بررسی پایداری کمپلکس های بازهای اسیدهای نوکلئیک با تعدادی از فلزات گروه اول و دوم (در فاز گازی) با استفاده از روش های ab initio

ساختار، خواص و عملکرد اسیدهای نولکییک تحت تاثیر برهمکنش های آنها با یونهای فلزی می باشد. این یونها نقش بسیار مهمی در پایداری و ناپایداری ساختار دو رشته ای dna جفت بازها و بازهای منزوی آن دارند برای درک نقش مهم کاتیونها در بیوفیزیک dna .ابتدا باید جزییات برهمکنش این یونها با بازهای منزوی مورد بررسی قرار گیرد. به منظور تامین این هدف در این پژوهش به مطالعه برهمکنش بازهای اسیدهای نوکلییک (آدنینی ، گوانین ، سیتوزین و تیمین) با یونهای ca2+,mg2+,be2+,rb+ و sr2+ .با استفاده از روش های مکانیک کوانتوم همچون هارتری –فاک(hf) تیوری دانسیته چگال ..و اختلال مولر-پلست mp2 پرداختیم. در این محاسبات از توابع پایه ..و نرم افزار مکانیک کوانتومی گوسین 98 استافده شده است . بررسی پایداری این کمپلکس ها و تمامی محاسبات در فاز گازی و بر روی کمپلکس هایی که یون فلزی به موقعیت n- ادنین n7 و o6گوانین، سیتوزینo2 و n1 تیمین متصل بود انجام شد. نتایج حاصل از بررسی بارهای جزیی و پارامترهای هندسی نشان دادکه موقعیت ..آدنین ..و گوانین و..و سیتوزین nو o2 تیمین فعالترین موضع ها برای برهمکنش با یونها هستند. روند تغییر ممان دو قطبی بازها در حین تشکیل کمپلکس برای بازهای مکمل در ساختار دو رشته ای dna کاملا مشابه گزارش شد. در نتیجه بررسی سطوح انرژی کمپلکس ها روند سیتوزین (تیمین (آدنین (گوانین برای پایداری آنها مشاهده شد انرژی برهمکنش تشکیل کمپلکس های مذکور با افزایش عدد اتمی یونهای فلزات گروه iو ii از میزان این گرمادهی کاسته می شود در مورد کمپلکس های تیمین شرایط متفاوت از دیگر بازها می باشد در واقع واکنش های تشکیل کمپلکس های تیمین با فلزات به استثناء be2و mg گرماگیر می باشد در حقیقت تیمین در ساختار دو رشته ای dna کمتر از دیگر بازها تحت تاثیر یونهای فلزی قرار می گیرد.